قد تكون عملية إزالة كيس المبيض مصحوبة ببعض الألم، لكن شدته تختلف من شخص لآخر بناءً على نوع العملية (سواء كانت بالمنظار أو من خلال شق جراحي) وقدرة الشخص على تحمل الألم.
بعد الجراحة، يتم التحكم في الألم عادةً باستخدام مسكنات موصوفة من الطبيب. قد تشعرين ببعض الانزعاج أو الألم في منطقة البطن خلال الأيام الأولى، وغالباً ما يكون الألم خفيفاً إلى متوسط الشدة ويتحسن تدريجياً مع مرور الوقت.